Филиппинские острова были открыты Фердинандом Магелланом в 1521 году и впоследствии были колонизированы Испанией. В 1896 году анти-испанское революционное общество Katipunan начало вооруженное восстание против колониальных властей, которое вылилось в филиппинскую революцию.

12 июня 1898 года генерал Эмилио Агинальдо провозгласил Декларацию о независимости и создание Первой Филиппинской республики.

Испания и Соединенные Штаты не признали независимость Филиппин. Это привело к Филиппино-американской войне, которую выиграли Соединенные Штаты. США оккупировали Филиппины, Первая Филиппинская республика была распущена.

Первоначально День независимости отмечался 4 июля — в день, когда в 1946 году Филиппины добились независимости от Соединенных Штатов. Дата была выбрана Штатами, т.к. это День независимости США. В 1964 году президент Диосдадо Макапагалом передвинул День независимости на 12 июня.